1、牙膏中的药物在口腔内不能保持太长的时间，即被漱口吐出，很难发挥药物作用。一般要求每次刷牙不得少于3分钟(多数人在1分钟左右刷完)，但药物很难在3分钟之内快速起到防治口腔疾病的作用。当然养成良好的刷牙习惯，天天刷牙，多次接触，也有一定的积累效果。

　　2、所用药物必须避免对口腔正常组织的损害。如牙石可用酸性药物溶解，但是，酸性药物又可损伤牙齿和牙龈组织，目前尚未找到仅对牙石有破坏作用，而又不损伤口腔正常组织的药物。

　　3、很难确定药物的有效浓度。浓度太高，有害口腔健康。浓度适当，当药物进入口腔后，又被唾液冲淡，而达不到足够的有效浓度。

　　4、药物的作用常被口腔内的污物(如牙石)阻挡，或受牙齿形态特征的限制，难以到达真正的易感病变区(如龋齿易感的窝沟和牙齿的邻接面)。

　　5、牙膏中的药品常因放置时间太久(主要是因为商品的贮存、运输所需要的时间)，可能发生其他的化学变化，失去原有的药效。

　　6、有效药品又常因带有难以被人接受的味道，而不适宜放在牙膏中。如尿素具有防龋效果，但其臭味不能被人们接受。