在解释淋菌性肛门直肠炎之前，先来谈一下淋菌的发现历史。

　　1897年Albert Neisser在患者尿道、阴道及新生儿眼内脓液中找到了淋球菌，故将淋球菌命名为淋病奈瑟菌(Neisseria gonorrhoeae)，三年后Leistikow和Loffler在体外分离培养成功。1885年Bumm在人、牛或羊的凝固血清上培养出该菌，并接种于健康人的尿道内亦产生同样的症状，淋球菌作为淋病的致病菌才得以确立。但是淋病与衣原体感染在20世纪初仍混为一谈。对症状较轻，尿道分泌物稀薄者认为是慢性淋病，直到应用青霉素将淋病治愈后，才认识到这种尿道炎为另一种性病。

　　人类是淋菌的唯一宿主。淋球菌对低等动物无致病能力，曾多次将人体尿道内含有淋球菌的脓液移植于兔子眼内，试图引起淋球菌结合膜炎，始终未获成功，说明人类缺乏杀灭淋球菌的能力。所以淋球菌只能侵袭人类。对于低等动物并无侵犯能力。

　　淋菌性肛门直肠炎主要见于男性同性恋，大约占到40%。妇女则多由阴道自身感染所致，能占总数的35%～50%。

　　直肠淋菌感染症状可仅仅有肛门瘙痒，无痛性黏液样脓性分泌物，或少量出血，也可表现有里急后重、有脓性便、肛管黏膜充血、脓性分泌物，淋球菌培养阳性，男性同性恋多无临床症状，分离出的淋球菌多为耐药菌株，这可能是由于某些高度敏感的菌株迅速被大便中胆盐或脂肪酸杀死，这类淋球菌耐胆盐和脂肪酸，染色体内常带有耐多种药物的耐药基因，治疗较困难。

　　由于疾病症状上的相似性，因此会有一些男性淋病与淋菌性肛门直肠炎混淆，这些疾病分别是：

　　（一）非淋菌性尿道炎

　　虽亦有不洁性交史，但潜伏期长（1～3周），症状轻微，尿道分泌物量少，呈浆液性或粘液脓性。沙眼原体和解脲支原体为主要病原体，少数可由阴道毛滴虫、念珠菌或单纯疱疹病毒引起，大肠杆菌见于男性同性恋的尿道炎患者。淋球菌检查阴性。

　　（二）非特异性尿道炎

　　指与性病无关的细菌性尿道炎，如继发于包茎的尿路感染，或继发于尿道导管插入术和其他尿道器械操作引起的损伤后感染。镜检常为革兰阳性球菌。

　　（三）Reiter综合征

　　主要症状发生次序为尿道炎、结膜炎和关节炎。发病与HLA-B 相关，病因多为沙眼衣原体（性病型）、肠道福氏痢疾杆菌（肠型）。偶见于淋菌性尿道炎后发病者，尚可伴发脓溢性皮肤角化症（掌跖多见）及环状龟头炎等皮肤粘膜损害。